Varje år genomför MHF mellan 20 och 25 centralt samordnade projekt. De flesta sker i någon form av samverkan med regioner och lokalavdelningar.
Det lokala arbetet utformas utifrån behov och arbetsmöjligheter i den eller de kommuner som respektive lokalavdelning omfattar, men med en särskild prioritering av aktiviteter som faller inom ramen för MHF:s prioriterade verksamhetsområden. Varje region har en verksamhetsplan för sitt område som uppdateras varje år. Det regionala arbetet har samma målfokus som det centrala men är anpassat efter varje regions behov och praktiska förutsättningar. Regionernas uppgift är att samordna projekt och verksamheter som aktiverar många lokalavdelningar.